Junko Shibuya est née et a grandi à Nishinomiya, dans la banlieue de Kobe, au Japon. Elle étudie le design au Musashino Art University à Tokyo. Après une longue expérience dans l’architecture, elle se lance en 1998 dans le design graphique ainsi que dans l'illustration. En 2000, avec la naissance de sa fille, elle commence à réaliser des livres pour enfants. Depuis 2005, elle vit et travaille en France.